Về chính sách thuế GTGT đối với phần phí để lại cho tổ chức cung cấp nước sạch thu phí bảo vệ môi trường đối với nước thải sinh hoạt, ngày 8/12/2020 Tổng cục Thuế đã có công văn số 5220/TCT-CS trả lời Cục Thuế thành phố Hồ Chí Minh, Quảng Bình, Hoà Bình, Vĩnh Long, Đồng Nai, Kiên Giang, Bắc Giang, Đồng Tháp với nội dung:

“Trường hợp các Công ty cung cấp nước sạch được UBND tỉnh giao thu tiền phí bảo vệ môi trường đối với nước thải sinh hoạt của các tổ chức, hộ gia đình, cá nhân sử dụng nguồn nước sạch thông qua hóa đơn tiền nước và được để lại 10% trên tổng số tiền phí bảo vệ môi trường thu được cho Công ty cung cấp nước sạch, phần còn lại nộp ngân sách Nhà nước thì số tiền phí được để lại là doanh thu đã có thuế GTGT, Công ty căn cứ số tiền phí được để lại xác định giá chưa có thuế GTGT để kê khai, nộp thuế GTGT theo quy định.”